杨逸医馆刚刚开张却无端卷入嗜睡症的怪病风波。警方下令严查此事，找出事情的根源所在。徐墨然主动请缨全权负责，怀疑或许与之杨逸相关，暗中潜入诊所盗取证物，却发现只是一些很常见的药材，两者并无关联。案件一时之间断了线索陷入困境……杨逸在乔兰和乔琴的帮助下，研制出可以有效地缓解嗜睡症的汤药，使病情得到了有效的缓解。担心父亲身体的徐墨然邀请杨逸前往徐府查看徐知事的病情。杨逸在诊治的过程中无意之间发现，徐知事床边散落的一些花粉，若有所思，决定以此为线索着手追查。正当杨逸与徐墨然一步步接近事件真相的同时，慕容南与灵元天

萧洛宸前往集市，在医馆中遇到了和陈汐瑶一模一样的人，萧洛宸冒充成伙计在医馆中工作，慢慢发现眼前的女子便是当初的陈汐瑶，而她却失忆了，萧洛宸决定默默守护，但温亦妍却从宫中逃了出来，利用毒药让陈汐瑶恢复了记忆，并下毒给萧洛宸，萧洛宸也在痛苦中晕倒，亡命鸳鸯再续前缘。

花店老板纪嘉儿是《医妃难囚》的死忠粉，在看过第一季后对结局不甘心，于是再度创作，将纪纤云重新送回过去与夫君亓凌霄在一起，但因第一季纪纤云在网文中已被写死，所以纪嘉儿另辟蹊径，脑洞大开，将纪纤云穿到了另一幅容貌的兰若溪身上。此时剧中纪纤云如愿回到古代，从高空坠落，惊喜地发现自己被太子亓凌霄接入了怀中，亓凌霄却嫌恶地把她扔在地上，她说自己是纪纤云，战王之子亓凌云却在一旁呼唤自己为“兰若溪”，并让自己放开太子殿下。纪纤云这才明白原来的自己已死，她不得已穿越到了另一人身上。眼见亓凌霄要把兰若溪抓起来，亓凌云连忙上

现代医生穿越成古代医妃云若月，为实现梦想“开一家属于自己的医馆”，融资、招商、搞事业！额外附赠爱情上门，云若月与王爷楚玄辰感情日渐升温。但危机随即而来，云若月深陷官司，王爷为救爱妃闯大狱劫法场，自己也迎来了新的挑战，且看二人如何共渡难关。