第二集中，尼奥（基努·里维斯KeanuReeves饰）没有能从内部摧毁“母体”，他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷，思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯（劳伦

　　尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵创造出来，周而复始的日常世界，另一个则是隐藏其后，真实

故事讲述鲍伯刚和恋情长跑的女友分手，心碎不已时巧遇一只可爱到不行的流浪猫，而鲍伯好友克拉伦斯更被小猫萌翻，两人给小猫取名‘Keanu’，而‘百炼钢化为绕指柔’大男人从此化身猫奴，每天陪猫、爱猫，与猫为伍。某天鲍伯的家被流氓集团闯空门，更惨的是他们的爱猫‘Keanu’竟然被绑架！为了营救爱猫，两人决定混入贩卖毒品的圈子，为方便接近流氓集团......