根据民国时期女特工刘君湘真实故事改编。

七个具有生命的人偶，七个美丽夺目的少女，她们已经超越人偶的存在，拥有不变的容颜，强大的力量。但却没有一个是父亲心里最完美的爱丽丝。痛苦的罗真消身匿迹，留下的蔷薇少女们。为了见到父亲，为了得到父亲的爱，她们坚信只要将姐妹体内的蔷薇圣母聚集到一起，便可以进化成为爱丽丝。罗真制造的七个蔷薇少女的传说，最终演变成一场她们自相残杀的战斗，但是这场战斗有个美丽的名字——Alice Game。就这样作为唯一的梦想，唯一活着的理由，她们不断觉醒又不断沉睡，与不同人缔结契约，在N之梦境中不断寻找姐妹战斗。

王强大从小拥有过人的逻辑推理能力，经常暗地协助检察官好友处理案件。凭着优异的数理能力，成为了知名的数学教授，但却因为一个承诺意外成为补习班的数学名师。汪蔷薇原是历史老师兼古董鉴定师，但却因为某个意外事件，成为了王强大的同事！当孤傲冷酷的王强大，遇上乐观热情的汪蔷薇，关于爱情跟未来，他是否能算得出来?

打扮成男子模样的少女·天上欧蒂娜因为某个原因而转学到贵族学校·凤学园，在那里，她遇到了被称为“蔷薇新娘”的美丽少女姬宫安希，从而被卷入了一场以争夺“蔷薇新娘”为目标的决斗游戏。与TV版相比，剧场版的很多设定都作了大幅度变更。监督几原邦彦在制作剧场版时减少了突发演出的场面，希望让观众更容易理解作品的意涵。画面比TV版更华丽且超乎现实，相对地，故事内容更现实而残酷。剧场版中，欧蒂娜幼时不曾遇见过王子，想成为王子是由于其他更强烈的理由；男装打扮也比TV版更为彻底，只有在决斗时才会把头发放下，动作和语气也显得更男

小虎曾是孟家养子，但意外导致养父过世，便离开孟家，漂泊十年后，成了走私贩。他偶然救下采芹和采薇两姐妹，更与采芹一见钟情，可采芹正是仕龙的未婚妻。采芹既迷恋小虎，又想嫁给仕龙做上等人。采芹与仕龙成亲那日，小虎欲带采芹私奔，采芹谎称妹妹采薇与小虎有私情，以保住自己与仕龙的婚姻。小虎为报复采芹，与采薇成婚，婚后两人有了感情。仕龙发现采芹才是与小虎私情的人，对小虎产生了仇恨，以多年前一桩绑架案抓捕起诉小虎。尔后仕龙悔悟自己被愤怒蒙蔽双眼，撤销了控诉。孟夫人也道出了小虎身世——小虎与仕龙是亲兄弟。小虎与采薇终成眷属

樱田纯是一名不愿上学而长期不出家门的中学生，热衷于上网购物，喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。有一天收到一封自称是人工精灵荷里耶的来信，上面只写着“上发条”、“不上发条”的选项，在好奇心的驱使下选择了“上发条”，之后房间就出现了一个没有署名的神秘皮箱，里面装着一个美丽而且质感近似真人的人偶少女。当纯使用木箱内的发条转动背部的开关后，人偶有生命般地活动起来，对纯说：“我是真红，蔷薇少女第五人偶。”正在这时，突然了出现被神秘人操控的小丑布偶，在生命受到威胁的紧急情况下，纯虽万般无奈还完全搞不清楚发生了什么

七个具有生命的人偶，七个美丽夺目的少女，她们已经超越人偶的存在，拥有不变的容颜，强大的力量。但却没有一个是父亲心里最完美的爱丽丝。痛苦的罗真消身匿迹，留下的蔷薇少女们。为了见到父亲，为了得到父亲的爱，她们坚信只要将姐妹体内的蔷薇圣母聚集到一起，便可以进化成为爱丽丝。罗真制造的七个蔷薇少女的传说，最终演变成一场她们自相残杀的战斗，但是这场战斗有个美丽的名字——AliceGame。就这样作为唯一的梦想，唯一活着的理由，她们不断觉醒又不断沉睡，与不同人缔结契约，在N之梦境中不断寻找姐妹战斗。

时间从初中直接跳到了大学。虽然课还有去上，打工也有做，纯依然还是过着家里蹲般的生活。某日在打工的店收到退回来的一本教导如何制作人偶的神秘杂志，纯受到了冲击。回家之后发现又寄来的杂志的第2期和附赠的人偶零件，并得知只要能凑齐这些杂志附送的零件便可以组装得到第5人偶真红。纯接受了邀请并开始组装零件，在数期之后却接到了神秘杂志社的休刊通知，并得知由于第7人偶雪华绮晶的干扰，零件也无法送到，需要纯自己去N之领域去拿；同一时刻还收到了一封来自过去的自己所发来的简讯，声称由于雪华绮晶的力量过于强大无法与其匹敌而需要借

在1927年的“七一五”反革命政变中，为了营救共产党员任致远，夏恒煊慨然赴死，留下妹妹夏雨竹与丫头霜菊相依为命。柔弱的雨竹独自谋生，霜菊则在恒煊恋人肖成碧的引荐下加入了国民党特务组织。几年后雨竹偶然营救了任致远。致远牺牲后，雨竹受感召成为中共地下情报工作人员，与此同时霜菊在特务组织内获得重用和提拔。抗战爆发，雨竹和霜菊再次相见，却为了各自的任务针锋相对。雨竹发现肖成碧的弟弟肖君浩和自己承担着共同的使命，两人在战斗中相知相爱。1949年国民党败逃台湾，雨竹毅然前往台湾执行任务，被身为保密局军官的霜菊发现。为