大宋年间，龙牙县旱情四起，当地百姓认为是锁龙井当中的龙王发怒，需将童男童女投入锁龙井祭祀蛟龙方能得享安宁。祭祀恶俗持续多时，每逢天灾就行祭祀之举，不知多少无辜孩童葬身井底。新科进士庄严刚任龙牙县主薄，

云隐镇上频发连环命案，一时间百姓们人心惶惶，决 定举行河神祭祀大典以求安宁。医师陶苒受命协查连环案，带着徒弟不苦探案过程中， 误打误撞的救了目睹案发的小狐狸花枝并结识了嗜酒如命的江湖术士肖叔。几人协力

南宋年间，通古县前任县令为了一己私利，利用“河神”为幌子暗中掳掠儿童，百姓惶惶不安，在其蛊惑下纷纷相信用孩童祭祀“河神”可以平息灾祸。宋慈受命来到通古，向百姓一再申明祭祀河神纯属无稽之谈，并保证一定会查出事情真相，他的到来使得老县令感觉到了威胁。在老县令的授意下，其党羽对宋慈阳奉阴违，并暗中施以压迫，企图神不知鬼不觉的将宋慈了结。在一波接一波的危险降临在宋慈身上时，孩童还在不断失踪，这使得老百姓对宋慈失去了信任，逼宋慈赶紧祭河神。宋慈顶着多方的压力，抽丝剥茧地调查，利用自己高超的法医学手段让尸体“开口说话