东北地方的某处深山，初中生小町在供奉熊的神社担当巫女的工作。某天，小町对身为监护人（人？）的熊·夏说“想要去都市的学校”。爱操心的夏，给干劲十足却缺乏毅力、不谙世事的小町准备了在都市生活所必要的试炼，但……。

皇缠是一名平凡的初中二年级女生，从小就离开了父母，和祖父母过着相依为命的生活，皇缠因此格外渴望亲情，也渴望着看似一成不变但实际上充满了小确幸的平静生活。草薙由麻是皇缠的好友，同时也是身上流淌着巫女血脉的巫女候补，肩上背负着沉重的责任。某一日，两人在前往神社的路上遭遇了一连串的意外，一个行踪诡异的男人成为了危害小镇宁静的不安定因素，为了压制疯狂的男人，由麻进行了“神悬仪式”，然而，让所有人都没有想到的是，被神明附身而拥有了能够降妖除魔的能力的人，却是皇缠。

公元2016年——。在釜谷市的天万神社做着巫女工作的初中2年生，皇缠。自幼与母亲分别的她，长年被寄养在祖父母的家中，从三个月前开始终于和父亲伸吾一起生活。也许是因为有过这种境遇的缘故，缠向往着平凡而安稳的日常。

描写了高中毕业和御影神社毕业临近，向着各自道路前进的奈奈生，巴卫，瑞稀、鞍马的最后时光

故事发生在山樱镇，主角大空亚子的班上突然新转来一位归国子女‧甲本翔。翔对灵异故事相当感兴趣，收集着世界上各式各样的怪谈。他对亚子描述的山樱镇灵异现象——“怪谈餐厅”十分好奇，拉着亚子前往参观。从此之后，亚子便经常遭遇奇异的事件…。据亚子描述，山樱镇里有许多灵异地点，因此也被称为「遭诅咒的小镇」。例如：树林包围的「山樱神社」、神社后面的「老婆婆山」、高楼「死神病院」、堆积于河边的「废弃车墓场」、河流的「幽灵住宅区」，以及传说夜间会营业的西餐厅废墟「怪谈餐厅」。都是会在动画中讲到的场所。