胡朋与苟友是情敌，苟友为了击败胡朋，反对胡朋在盐碱地里建糠醛厂，并支持日本女孩樱木晴子来投资开发水田，为此，苟友处处给胡朋找麻烦，不惜谎称厂址里的孤坟是自己祖坟，并开坟验证，谁知坟里只有一具狗骨头。经历了一连串哭笑不得的误会之后，胡朋发现自己的糠醛厂硫酸废液无处排放，若在盐碱地开发水田，因为土质原因，水稻也不会生长。苟友从‘酸碱中和’得到启发，提议用胡朋糠醛厂的硫酸废液排放到盐碱地里，利用酸性来中和盐碱地的碱性，一石二鸟，同时解决了糠醛厂无法排污和盐碱地土质差、无法改成水田的难题。最终，在一片笑声中，双方

故事发生在近未来的日本，一个叫疏濑的城市中。市民们过着平凡的生活，只不过在城市的一角，山冈上矗立着外形酷似熨斗的医疗机器制造厂，每到固定时刻，那个工厂都会像刚烫完东西一样散发出大量的蒸汽。小学六年级学生直太，高中女生真见美，直太留学的哥哥的女友，三个人一起在河边打发时间。本该一如往常的日子，随着传说中的蜜蜂女——睛子驾驶的机车撞上直太而结束了。直太头上长出了奇怪的角，而睛子居然成为了直太家的佣人？！睛子的秘密与她常念起的“FLCL”的含义，令直太的生活有了翻天覆地的改变。