白赖仁野心勃勃，一心想控制人类，差仁者领袖虎大介杀死了菊池博士，抢走了万能的“赤盒”，伹他却打不开。得知音乐家高比能打开盒子，他遂派人将其生擒。与此同时，菊池的学生女忍者香也在追杀高比，而令一面，芭蕉

在睡梦中，大空看到很奇怪的景象，但一觉醒来，却发现自己要迟到了······于是大空骑车飞奔回校，不幸吃了一球，和萩原大介撞在一起······幸得麻衣子相救，大空才躲过被揍的厄运。教室里，麻衣子通过利诱和恐吓，逼使大空放学跟她一起走······放学后，麻衣子为了让大空改掉半途而废的坏习惯，带了他到龙宫城的地下游戏中心。在惊讶和兴奋之余大空跟麻衣子去注册，并“挑选”（电脑根据个人资料选择）了一条“睡龙”（战斗力为0），随即便加入战斗。大空在抱怨下被迫参赛，进入模拟世界后很快就遭到大介的风之龙的攻击。带同センコ

鲁邦三世是怪盗绅士亚森·雷朋的孙子，被称为世界最杰出的神偷，在偷东西前总是会发出预告信。他与拔枪只需0.3秒的神枪手次元大介、无所不斩的居合道高手石川五右卫门、神秘欧亚混血女盗峰不二子，合作偷遍全世界。钱形警部是钱形平次的后裔，一直想要逮捕他们，但全部以失败告终。