升入私立咲钟湖学园高中的阿佐谷未乃爱，只是个动画的入门菜鸟，但她却被同年级的上井草有栖强行邀请成立了动画研究部。通过与同年级的高圆寺美子以及喜爱动画的前辈们相遇，未乃爱逐渐沉浸在动画的世界中。动研部员一边要面对学生会固执的废部劝告，一边对于渐渐逼近的世界灭亡一无所知，成天在活动室、在秋叶原、在圣地、在温泉，聊着动画的事情。

府上高中有名的不良学生风间坚次，某日为了宣扬自己的名声而踏入了社团“游戏制作部”的大门。在那里，有正在社团活动室里进行秘密活动的4名女子部员，被发现“真相”的部员们为了掩盖事件“袭击”了看到的风间三人，并打算消除三人的记忆，从部员手中拼死逃出来的坚次，遭到了部员的“追杀”，最后却在部长柴崎芦花的“帮助”下加入了游戏制作部。被强拉进制作部的风间，接下来的生活会变得怎样？在这包含各种属性自称部员的社团，到底是地狱还是天堂？

位于东京台场，拥有自由校风和多项专科的人气高中「虹咲学园」。对学园偶像的魅力感到心动的普通科2年级高咲侑，和儿时玩伴上原步梦一起敲响了「学园偶像同好会」的门。有时作为对手，有时作为同伴，胸怀各自的心意，每天展开活动的成员们。「如果能够为追逐梦想的人加油的话……。」9名与1名少女所编织的，第一次的「大家实现梦想的故事（School Idol Project）」。传达到吧！我们的心动——。现在，再一次追逐梦想吧！